合成サービスの内容
●8,000bpまでの鎖長を持つ遺伝子
の”合成””配列確認”および大腸菌
クローニング。
●お客様の仕様に従った遺伝子変
異の合成。
●弊社独自のバイオ・インフォマティ
ック・ソフトウエアーによる望ましい
ホストシステムの発現とコドン・至適
化。
●高品質の
SlonoMax変異体ライブ
ラリーによる合成。
●特異的トリプレット・ビルディング・
ブロックで望ましい変異をいかなる
配列部位にても挿入でき、その頻
度と分布を制御できます。
使い易い注文プラットフォ−ム
Sloning社のウエブサイトは秘
密を最大に遵守、安全かつ使
い易い注文の形をご用意しま
した。
合成したお客様の遺伝子は、
凍結乾燥したDNAとしてお届
けします。同時に品質の諸証
書と詳細な製品情報入りCD
が添付されます。
全ての操作ステップを工業用
プラットフォームへ
合成される遺伝子内容に関わらず
Slonomicsプロセスは高度かつ標準化し
た反応サイクルにより行なわれます。
プロセス終了後、合成した遺伝子は望
ましいアプリケーションに、いつでも利用
できるように適切な大腸菌ベクターにク
ローニングされます。
Slonomicsの製品特徴
●最高の製品品質
●信頼のある作成
●自動化に直結するテクノロジー
既知のタンパク質の性質を改変、
至適化するため、変異ライブラリー
は制御された進化工学実験おいて
利用されています。
タンパク質の構造や機能に対する、
特異的な変異の影響を調べます。
この目的のため、特異的なアミノ酸
置換を可能にする変異遺伝子の構築
が必須となります。これらの変異体は
ライブラリー内で構築され、適切なスクリ
ーニング方法を通じて解析されます。成功
の鍵は、ライブラリーの品質に拠ります。
Statistics are good- control is better
今日に至るまで、変異体ライブラリーの作製にはPCR法による遺伝子の改変に基づいていました。ターゲットのタ
ンパク質に関する情報が少しでもあれば、error-pronePCR法のような統計的な方法により、ある特異的な遺伝
子配列内にランダムな変異を引き起こすことができます。しかし、バリアントの不完全な表現型がみられたり、目
的外の副産物が生じたりするなど解決すべき点が残っています。「Neylon at al NAR 32(4), (2004): 1443-59)。
突然変異体ライブラリー作製の別の方法には、degenerateオリゴヌクレオチド(ウォッブル・オリゴ)[wooble oligo]
を用いた変異体の半制御された導入が挙げられます。 この方法では、ヌクレオチドを明確に標的とし、改
変する事はできますが、それらの変異の正確な特徴についてはわずかに制御できるにすぎません。
その結果、degenerate-PCR法により製作されたライブラリーには目的の突然
変異体は含まれているものの、望ましくない変異体も変異体も含まれてしまいます。
なぜなら、望ましくない配列領域内にランダムに生じた変異の数が高くなる傾向が
あるからです。遺伝子コードの特徴が与えられれば(つまり、あるアミノ酸が、その
他のコドンよりもより一致したコドンを有している)、Degenerateオリゴヌクレオチドを
利用した場合、タンパク質レベルで不均一な変異体の表現型が出てしまいます。
続いて行なうスクリーニングのプロセスでは、入念に行なわなければなるだけでは
なく、時間を浪費することになってしまいます。